RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 TNNI3P19429 210 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 GGT5P36269 586 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PIGAP37287 484 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNC1P48547 511 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPA7P48741 367 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MAN2A2P49641 1150 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 WNT3P56703 355 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TGM3Q08188 693 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ASPHQ12797 758 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SERTAD2Q14140 314 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 DOC2AQ14183 400 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC10A1Q14973 349 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PIGGQ5H8A4 983 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 GPSM1Q86YR5 675 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ACOT4Q8N9L9 421 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF721Q8TF20 911 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SARAFQ96BY9 339 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR34Q96EX3 536 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 VPS39Q96JC1 886 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNC2Q96PR1 638 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 DERL2Q9GZP9 239 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RHOJQ9H4E5 214 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LDAHQ9H6V9 325 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SNX12Q9UMY4 172 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 HRKO00198 91 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CES2O00748 559 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CLGNO14967 610 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TP73O15350 636 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNAB3O43448 404 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 FGF17O60258 216 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 HCN1O60741 890 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SH3BGRLO75368 114 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 STK16O75716 305 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SCELO95171 688 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV3-11P04433 115 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 EPORP19235 508 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 STT3AP46977 705 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL4CP56559 192 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RUNX1T1Q06455 604 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 DMTNQ08495 405 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4D1Q15615 310 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PDK4Q16654 411 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MPEG1Q2M385 716 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 WLSQ5T9L3 541 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LYPD8Q6UX82 237 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 NUBPLQ8TB37 319 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ESAMQ96AP7 390 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MS4A8Q9BY19 250 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 EXO5Q9H790 373 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC166P0CW27 439 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 COX7A2P14406 83 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 GABRA1P14867 456 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MSH2P43246 934 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms