RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	CT45A9	P0DMV2	189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FER	P16591	822 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CYP3A5	P20815	502 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PDE7A	Q13946	482 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	P2RY14	Q15391	338 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TRADD	Q15628	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	LYG1	Q8N1E2	194 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PARP8	Q8N3A8	854 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GLYATL1	Q969I3	302 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SNX21	Q969T3	373 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CABS1	Q96KC9	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MTRR	Q9UBK8	725 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	HCFC1	P51610	2035 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TXNDC12	O95881	172 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	HP	P00738	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MT-ND1	P03886	318 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ATP6V1B1	P15313	513 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	HERV-K104	P63124	156 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	NPRL3	Q12980	569 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RPA4	Q13156	261 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ITIH5	Q86UX2	942 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CDC20B	Q86Y33	519 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SPC24	Q8NBT2	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PSMB7	Q99436	277 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SPATA2	Q9UM82	520 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SLC28A1	O00337	649 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ATP6V1G1	O75348	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	REN	P00797	406 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	HCK	P08631	526 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	BCL3	P20749	454 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GEM	P55040	296 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GALK2	Q01415	458 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PPP2R5C	Q13362	524 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CCL14	Q16627	93 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	HFE	Q30201	348 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	EPC2	Q52LR7	807 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MPPE1	Q53F39	396 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	C1orf189	Q5VU69	101 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RTL6	Q6ICC9	239 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF410	Q86VK4	478 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ABCG4	Q9H172	646 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GAN	Q9H2C0	597 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88

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