RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 ELP6Q0PNE2 266 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TWF1Q12792 350 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 PEA15Q15121 130 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 FCN2Q15485 313 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 CBWD6Q4V339 395 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MSS51Q4VC12 460 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 NAT16Q8N8M0 369 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 NEK7Q8TDX7 302 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 HAS1Q92839 578 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 UCN3Q969E3 161 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ATG4CQ96DT6 458 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 NANSQ9NR45 359 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM72A0PK05 275 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 OR6C68A6NDL8 312 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 K7ERI5 159 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 IMPA2O14732 288 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SURF4O15260 269 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 DDAH1O94760 285 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 PRSS23O95084 383 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 AHSA1O95433 338 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 LATS1O95835 1130 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SPARCP09486 303 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 DAOP14920 347 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RHCEP18577 417 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 HDCP19113 662 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SSTR2P30874 369 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 GRK5P34947 590 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 THBS4P35443 961 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 AHRP35869 848 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TGFBR1P36897 503 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP12P39900 470 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SPP2Q13103 211 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TNFAIP1Q13829 316 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 GJB7Q6PEY0 223 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 OSTF1Q92882 214 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC35C1Q96A29 364 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TADA1Q96BN2 335 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 DERL2Q9GZP9 239 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 COL6A3P12111 3177 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 AP4M1O00189 453 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ARPC2O15144 300 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SIGLEC5O15389 551 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 PLA2G10O15496 165 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TSPAN2O60636 221 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 RP2O75695 350 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 CD2P06729 351 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 FHP07954 510 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms