RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRABD2AQ86V40 505 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARMC10Q8N2F6 343 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AGAP11Q8TF27 550 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RIT1Q92963 219 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAAR6Q96RI8 345 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNPPD1Q9BV87 410 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDAH2O95865 285 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SP1P08047 785 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IMPG1Q17R60 797 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MREGQ8N565 214 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR4K14Q8NGD5 310 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR8K3Q8NH51 312 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASB15Q8WXK1 588 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NR4A3Q92570 626 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCMH1Q96GD3 660 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MKS1Q9NXB0 559 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYOTQ9UBF9 498 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSME2Q9UL46 239 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLLPQ9Y342 182 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TIMM22Q9Y584 194 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1orf226A1L170 272 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A8MVJ9 347 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WWP2O00308 870 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR2J2O76002 312 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEURL1O76050 574 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC35E2P0CK97 266 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF4P78317 190 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACSM2AQ08AH3 577 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KRT71Q3SY84 523 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPIN4Q56A73 249 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPDYAQ5MJ70 313 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACSM2BQ68CK6 577 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C10orf107Q8IVU9 208 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BANPQ8N9N5 519 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXL20Q96IG2 436 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNA7Q96RP8 456 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLX1AQ9BQ83 275 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HES7Q9BYE0 225 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACPTQ9BZG2 426 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HPF1Q9NWY4 346 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ESPL1Q14674 2120 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL12A1Q99715 3063 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PGRMC2O15173 223 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PMP22Q01453 160 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC29A4Q7RTT9 530 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF321PQ8N8H1 164 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF721Q8TF20 911 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM111AQ96PZ2 611 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SENP1Q9P0U3 644 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAB21Q9UL25 225 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WASHC1A8K0Z3 465 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDH7O60245 1069 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NME2P1O60361 137 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM13O60858 407 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPAG7O75391 227 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NME2P22392 152 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALNSP34059 522 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH9A1P49189 494 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HTR6P50406 440 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 XKP51811 444 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HK2P52789 917 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERVK-8P63133 956 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HMGCS1Q01581 520 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BTKQ06187 659 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPRED3Q2MJR0 410 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GFRALQ6UXV0 394 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF111Q6ZNA4 994 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALNT12Q8IXK2 581 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHTF18Q8WVB6 975 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRMOQ9BU70 441 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCM8Q9UJA3 840 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms