RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ARL10Q8N8L6 244 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR8K5Q8NH50 307 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR5AK3PQ8NH89 298 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZFAND2BQ8WV99 257 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 LCN9Q8WX39 176 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 SNX19Q92543 992 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RSC1A1Q92681 617 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GIMAP5Q96F15 307 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 KCNC2Q96PR1 638 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf62Q9BQA9 187 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP21Q9H596 190 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 IL21RQ9HBE5 538 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 BCL2L10Q9HD36 194 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MIEF1Q9NQG6 463 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ACER3Q9NUN7 267 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C5AR2Q9P296 337 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 THADAQ6YHU6 1953 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH15Q96QU1 1955 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A0G2JNG1 304 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 SEC14L2O76054 403 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 ACADMP11310 421 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FOSL2P15408 326 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF1BP20333 461 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MAGP20916 626 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K8P41279 467 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 CRATP43155 626 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SSR2P43308 183 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GABRA4P48169 554 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ5P48544 419 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G16P53816 162 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CXCR4P61073 352 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ACTR1AP61163 376 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TEKQ02763 1124 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TDGQ13569 410 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RAPSNQ13702 412 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RUNX2Q13950 521 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KIR2DS5Q14953 304 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP7Q16829 419 aa5.33□□□□□ -1.56
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