RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 GLOD5A6NK44 160 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PLPP1O14494 284 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 BCKDKO14874 412 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 DYRK3O43781 588 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 OR10H2O60403 315 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 GLI4P10075 376 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 MTHFD2P13995 350 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 GFAPP14136 432 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 IGFBP2P18065 325 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 MSX1P28360 303 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PIK3CBP42338 1070 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 HERVK_113P63132 956 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ERVK-8P63133 956 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PLIN5Q00G26 463 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFRSF17Q02223 184 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 CAV1Q03135 178 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDH1Q08174 1060 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC10A1Q14973 349 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PFKFB4Q16877 469 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 MROH9Q5TGP6 573 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR180Q86V85 440 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM13CQ8NE31 585 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 NUBPLQ8TB37 319 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TANKQ92844 425 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXL20Q96IG2 436 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 LDAHQ9H6V9 325 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 EXO5Q9H790 373 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ACTR8Q9H981 624 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PHF11Q9UIL8 331 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 NF1P21359 2839 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GVC2 190 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PR48 441 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ESYT3A0FGR9 886 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SYCE1LA8MT33 242 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 AQP7O14520 342 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 LRATO95237 230 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR75O95800 540 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 C2P06681 752 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 BSGP35613 385 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PIK3CGP48736 1102 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 MAN2A2P49641 1150 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNJ2P63252 427 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 NAB1Q13506 487 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SETDB1Q15047 1291 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TESK1Q15569 626 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 RTL6Q6ICC9 239 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 LYPD8Q6UX82 237 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 RIT1Q92963 219 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ART5Q96L15 291 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TTYH2Q9BSA4 534 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SNX15Q9NRS6 342 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 MED13LQ71F56 2210 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCA4P78363 2273 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A087X1B8 175 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0A6YYD5 115 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms