RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.117e-8■□□□□ 8.5
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RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA0040Q15053 153 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZSR9 355 aa15.71■□□□□ 0.11
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RABGEF1-204ENST00000442563 CCT7Q99832 543 aa15.71■□□□□ 0.11
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
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RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV17A0A0B4J275 112 aa15.7■□□□□ 0.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.7■□□□□ 0.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB9Q96C00 473 aa15.7■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.7■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.7■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa15.7■□□□□ 0.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa15.69■□□□□ 0.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR5L2Q8NGL0 311 aa15.69■□□□□ 0.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 COPS7AQ9UBW8 275 aa15.69■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.69■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.69■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP46Q8IYW2 2715 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 GABRR3A8MPY1 467 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 J3QKU1 62 aa15.68■□□□□ 0.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 KIRREL3Q8IZU9 778 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 FCRL1Q96LA6 429 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.12e-7■□□□□ 9.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 LRTM1Q9HBL6 345 aa15.68■□□□□ 0.1
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