RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CHTF18Q8WVB6 975 aa19.39■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 PRM3Q9NNZ6 103 aa19.39■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 RNF6Q9Y252 685 aa19.39■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0A6YYD5 115 aa19.38■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 FIGNL2A6NMB9 653 aa19.38■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 AQP7O14520 342 aa19.38■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 PROM1O43490 865 aa19.38■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 SUSD5O60279 629 aa19.38■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 C18orf63Q68DL7 685 aa19.38■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa19.38■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 LYPD8Q6UX82 237 aa19.38■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa19.38■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 SERPINB8P50452 374 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 GXYLT1Q4G148 440 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRD1Q6QNK2 874 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 SYT10Q6XYQ8 523 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 RELL1Q8IUW5 271 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 RPRMLQ8N4K4 120 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 IPPKQ9H8X2 491 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 PNPLA3Q9NST1 481 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 EML6Q6ZMW3 1958 aa19.37■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF407Q9C0G0 2248 aa19.36■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 GPR75O95800 540 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 NR2F6P10588 404 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 ACVR2AP27037 513 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 MSX1P28360 303 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 DNASE1L1P49184 302 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 NUP107P57740 925 aa19.36■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 C8orf74Q6P047 294 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT13Q86X67 352 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 FBXW8Q8N3Y1 598 aa19.36■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 ISL2Q96A47 359 aa19.36■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 ACSS3Q9H6R3 686 aa19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 CNIH4Q9P003 139 aa19.36■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 TMPRSS11DO60235 418 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 WDR1O75083 606 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 EEDO75530 441 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
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LIMS1-208ENST00000428064 FBXO45P0C2W1 286 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 FAM58BPP0C7Q3 252 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 TYK2P29597 1187 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 SLC37A1P57057 533 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 HERVK_113P63132 956 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 ERVK-8P63133 956 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 TLE4Q04727 773 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 PMPCAQ10713 525 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 SLC10A1Q14973 349 aa19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 EBPQ15125 230 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
LIMS1-208ENST00000428064 TECRLQ5HYJ1 363 aa19.35■□□□□ 0.69
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