RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 CABS1Q96KC9 395 aa3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 HSD17B14Q9BPX1 270 aa3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 MTRRQ9UBK8 725 aa3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 HCFC1P51610 2035 aa3.36□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 TXNDC12O95881 172 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 HPP00738 406 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 MT-ND1P03886 318 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 HERV-K104P63124 156 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 HSPA14Q0VDF9 509 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 NPRL3Q12980 569 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 RPA4Q13156 261 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 ZNF774Q6NX45 483 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 TMUB2Q71RG4 321 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 ITIH5Q86UX2 942 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 CDC20BQ86Y33 519 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 SPC24Q8NBT2 197 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 GOLGA5Q8TBA6 731 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 PSMB7Q99436 277 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 MID1IP1Q9NPA3 183 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 SPATA2Q9UM82 520 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.35□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 SLC28A1O00337 649 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 ATP6V1G1O75348 118 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 RENP00797 406 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 HCKP08631 526 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 BCL3P20749 454 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 GEMP55040 296 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 GALK2Q01415 458 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 CCL14Q16627 93 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 HFEQ30201 348 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 EPC2Q52LR7 807 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 MPPE1Q53F39 396 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 C1orf189Q5VU69 101 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 RTL6Q6ICC9 239 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 ZNF410Q86VK4 478 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 MSANTD4Q8NCY6 345 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 PNPLA2Q96AD5 504 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 ABCG4Q9H172 646 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 GANQ9H2C0 597 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 DPEP3Q9H4B8 488 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM39-211ENST00000426951 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 FGD5Q6ZNL6 1462 aa3.34□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SH3BGRLO75368 114 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SFTPBP07988 381 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ATP6V1B1P15313 513 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 FOSL2P15408 326 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 PTGER3P43115 390 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ALDH3B1P43353 468 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TKTL1P51854 596 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 LIMK2P53671 638 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 EMC2Q15006 297 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 EIPR1Q53HC9 387 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 UNC50Q53HI1 259 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ARMCX5Q6P1M9 558 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 RAPH1Q70E73 1250 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CNTN4Q8IWV2 1026 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 OR4F5Q8NH21 305 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1524Q8TCG1 905 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ITLN1Q8WWA0 313 aa3.33□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms