RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PXKQ7Z7A4 578 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 UCN3Q969E3 161 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM162AQ96A26 154 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 APOL5Q9BWW9 433 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 REEP1Q9H902 201 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NTMQ9P121 344 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX21Q9UL17 535 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DOCK8Q8NF50 2099 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CISD3P0C7P0 127 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HK1P19367 917 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK6Q00534 326 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf59Q7L2K0 433 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NPAS4Q8IUM7 802 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR48Q8TAF3 677 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DMRT3Q9NQL9 472 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CHP2O43745 196 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1G1P47890 313 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EVX1P49640 407 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS4P49798 205 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FABP5Q01469 135 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1211LQ6NV74 962 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OLIG3Q7RTU3 272 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ELMO1Q92556 727 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PHOX2BQ99453 314 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DDOQ99489 341 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NIPAL2Q9H841 368 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A4GALTQ9NPC4 353 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IL20Q9NYY1 176 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNE5Q9UJ90 142 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH1A1P00352 501 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ABATP80404 500 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF805Q5CZA5 627 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SGO1Q5FBB7 561 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TPGS2Q68CL5 300 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NELL1Q92832 810 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ASPNQ9BXN1 380 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX5Q9Y5X3 404 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IRAK3Q9Y616 596 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQY0 241 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX28O15482 410 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKYO43930 277 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRM4P08173 479 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OSMP13725 252 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RHCEP18577 417 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGP20916 626 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIBP23284 216 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL23P55773 120 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IRF8Q02556 426 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP6Q16828 381 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC36A2Q495M3 483 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC58Q4VC31 144 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IFI44LQ53G44 452 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R42Q7RTR8 314 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP14Q86UN6 197 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52P1PQ8NH57 321 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52J3Q8NH60 311 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCB9Q9NP78 766 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 INSL5Q9Y5Q6 135 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM172BPA6NC97 362 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF10AO00220 468 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD11O00231 422 aa3.43□□□□□ -1.86
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