RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3BP5O60239 455 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10H3O60404 316 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS19P39019 145 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH9A1P49189 494 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 IL17RDQ8NFM7 739 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 UCK2Q9BZX2 261 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCG4Q9H172 646 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PRRT4C9JH25 899 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA7AO75326 666 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNKO75909 580 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ERAP2Q6P179 960 aa17.74■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 VN1R5Q7Z5H4 357 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 MTERF3Q96E29 417 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SMURF1Q9HCE7 757 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SLAMF7Q9NQ25 335 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 C5AR2Q9P296 337 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KCND3Q9UK17 655 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 WWP2O00308 870 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX4O95219 450 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR32P1Q8NGA4 272 aa17.74■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A19Q9HC21 320 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 REV1Q9UBZ9 1251 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 DSPPQ9NZW4 1301 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN11A1L157 253 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CSO75390 466 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SCG5P05408 212 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 OSMP13725 252 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 COPZ1P61923 177 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL7AQ4VC05 210 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 BARHL1Q9BZE3 327 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ARRDC5A6NEK1 342 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 AGRPO00253 132 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAP00813 363 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ADH5P11766 374 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 OPRD1P41143 372 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TGM4P49221 684 aa17.73■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 DCST1Q5T197 706 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC5DQ6UXZ4 953 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL6Q8WZ60 621 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 WFDC6Q9BQY6 131 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TPK1Q9H3S4 243 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 MARCH7Q9H992 704 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SNTG1Q9NSN8 517 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA7Q9P0W8 599 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL3Q9UH77 587 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KNL1Q8NG31 2342 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BQ06 376 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CD72P21854 359 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 DGKGP49619 791 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPB3Q12988 150 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SPHARQ15513 63 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMAT1Q5H9K5 638 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TCTN3Q6NUS6 607 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR151Q8TDV0 419 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NEK6Q9HC98 313 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 DYRK4Q9NR20 520 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D24Q9ULP9 559 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 GON4LQ3T8J9 2241 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 LILRB5O75023 590 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SOD1P00441 154 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PIPP12273 146 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 WASP42768 502 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2B6P58173 313 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 IFITM2Q01629 132 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RHAGQ02094 409 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NFE2L1Q14494 772 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 AGAP6Q5VW22 663 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PAQR6Q6TCH4 344 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NRARPQ7Z6K4 114 aa17.72■□□□□ 0.43
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