RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 CALHM2Q9HA72 323 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 UBTD1Q9HAC8 227 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM7Q9NQW5 492 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC3AO75596 197 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 AHSGP02765 367 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 HPNP05981 417 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 GDF5P43026 501 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 CPA2P48052 419 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP1-1Q07627 177 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 RCN2Q14257 317 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R3AQ16821 1122 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 EIPR1Q53HC9 387 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 NHSL2Q5HYW2 709 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 HMBOX1Q6NT76 420 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 OR4N5Q8IXE1 308 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 SLC44A1Q8WWI5 657 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 UBQLN3Q9H347 655 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 TSPY26PQ9H489 355 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 NDRG3Q9UGV2 375 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 TESMINQ9Y4I5 508 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 ANKDD1BA6NHY2 528 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB108AA8MXU0 73 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 FPR1P21462 350 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINB3P29508 390 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 MSH2P43246 934 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 FNDC7Q5VTL7 733 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 BICRALQ6AI39 1079 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 PLXDC2Q6UX71 529 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 DIO2Q92813 273 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 GNRHR2Q96P88 292 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 F2RL3Q96RI0 385 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 IKBKGQ9Y6K9 419 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 DSCAMO60469 2012 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 CTIFO43310 598 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 FGF17O60258 216 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 WDR47O94967 919 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 NID1P14543 1247 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 GNAZP19086 355 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEA3P43357 314 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 STT3AP46977 705 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 NTRK2Q16620 822 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 MCUQ8NE86 351 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3IP1Q96FE7 263 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 DGAT2Q96PD7 388 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 GAL3ST4Q96RP7 486 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 SFXN3Q9BWM7 321 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 NT5DC2Q9H857 520 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 LYRM4Q9HD34 91 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 SLC17A6Q9P2U8 582 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD33BA6NCL7 494 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 A8MXE2 369 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 CDC7O00311 574 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 FGGP02679 453 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC175P0C221 793 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 COX7A2P14406 83 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 GSTM2P28161 218 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 PTH2RP49190 550 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 NAGLUP54802 743 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 RCAN2Q14206 197 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 TOMM20Q15388 145 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 TBCELQ5QJ74 424 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM64Q6YI46 380 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 UBE3DQ7Z6J8 389 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 KRT78Q8N1N4 520 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 ZPLD1Q8TCW7 415 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 EGFL8Q99944 293 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 TUBA1CQ9BQE3 449 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 GSX2Q9BZM3 304 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 C15orf41Q9Y2V0 281 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
HOXD12-201ENST00000404162 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF4O60810 478 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 RCBTB2O95199 551 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 KRT14P02533 472 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 RPL21P46778 160 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 NTNG2Q96CW9 530 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL20Q96IG2 436 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 RILPQ96NA2 401 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 WWTR1Q9GZV5 400 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL28Q9NXS3 571 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 HEATR5AQ86XA9 2040 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 SNPHO15079 494 aa17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.8 ms