RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.55□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 NCKAP5O14513 1909 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 HRKO00198 91 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DYRK3O43781 588 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 WDR1O75083 606 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SUPT3HO75486 399 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 KRT38O76015 456 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 LRATO95237 230 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GP5P40197 560 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ADH7P40394 386 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PAFAH1B1P43034 410 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 STT3AP46977 705 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RAP1GDS1P52306 607 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RAB10P61026 200 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GNG11P61952 73 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 KCNJ2P63252 427 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 FOXO1Q12778 655 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SLAMF1Q13291 335 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 MPEG1Q2M385 716 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PIGGQ5H8A4 983 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RAPH1Q70E73 1250 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CHSY3Q70JA7 882 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 UBE2E3Q969T4 207 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CPNE1Q99829 537 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 OR51B5Q9H339 312 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ALG9Q9H6U8 611 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.54□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 AKAP9Q99996 3911 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 UBXN8O00124 270 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SUSD5O60279 629 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 HCN1O60741 890 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 FAM155BO75949 473 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TRPC1P48995 793 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 IST1P53990 364 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 DLX5P56178 289 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 HERVK_113P63132 956 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ERVK-8P63133 956 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PLIN5Q00G26 463 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TNFRSF17Q02223 184 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 FOLH1Q04609 750 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CALCOCO2Q13137 446 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SLMAPQ14BN4 828 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 TBCCQ15814 346 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 C18orf63Q68DL7 685 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 CMC1Q7Z7K0 106 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 LAS2Q8IYD9 372 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 BBOF1Q8ND07 529 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 FAM13CQ8NE31 585 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 OR7G3Q8NG95 312 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 NUBPLQ8TB37 319 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ART5Q96L15 291 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 OPTCQ9UBM4 332 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms