RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 CLRN2A0PK11 232 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SLC15A5A6NIM6 579 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 H7C0C1 242 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 I3L4J1 428 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 K7ERI5 159 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MCF2LO15068 1137 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 VILLO15195 856 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 WDR46O15213 610 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FAM189A1O60320 539 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 BAG2O95816 211 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 APOEP02649 317 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 AOC1P19801 751 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 CCND2P30279 289 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MIPP30301 263 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TNFSF9P41273 254 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 ATP5OP48047 213 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 PRKCEQ02156 737 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ASPHQ12797 758 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LTBP4Q8N2S1 1624 aa3.25□□□□□ -1.89
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