RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GMPRP36959 345 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GLP1RP43220 463 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ERVPABLB-1P60509 514 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CDKL4Q5MAI5 379 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SPERTQ8NA61 448 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NEIL3Q8TAT5 605 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SARDHQ9UL12 918 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GPR34Q9UPC5 381 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SLC16A8O95907 504 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GNG2P59768 71 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ARPC4P59998 168 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PLCXD2Q0VAA5 305 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 RPA4Q13156 261 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR4C11Q6IEV9 310 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TMED4Q7Z7H5 227 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SLC37A3Q8NCC5 494 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 UNC119BA6NIH7 251 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CD83Q01151 205 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PON2Q15165 354 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM107Q6UX40 140 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 RMI1Q9H9A7 625 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR2B3O76000 313 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CLCN2P51788 898 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYND11Q15326 602 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GPAT4Q86UL3 456 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SLC44A3Q8N4M1 653 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CHST14Q8NCH0 376 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MGLLQ99685 303 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 IL26Q9NPH9 171 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM184CQ9NVA4 438 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SPO11Q9Y5K1 396 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SOX2P48431 317 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HTR6P50406 440 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HK3P52790 923 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MLLT10P55197 1068 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NFE2L1Q14494 772 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 AAK1Q2M2I8 961 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CLLU1OSQ5K130 101 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LRIF1Q5T3J3 769 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.691e-6■■■□□ 16.5
CCSAP-203ENST00000366687 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 STRADBQ9C0K7 418 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT15Q9NV35 164 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CNMDO75829 334 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 STOMP27105 288 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PYHIN1Q6K0P9 492 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR8K5Q8NH50 307 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TGM7Q96PF1 710 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MROQ9BYG7 248 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LRP6O75581 1613 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LRRN3E7EW58 273 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf98E9PRG8 122 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SPARCP09486 303 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HLCSP50747 726 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PLP2Q04941 152 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR52N2Q8NGI0 321 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LRRN3Q9H3W5 708 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM30A4D0T7 59 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 G3V2L1 256 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R38P59533 333 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 RAB39AQ14964 217 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SYCE2Q6PIF2 218 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 COMMD6Q7Z4G1 85 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TEX26Q8N6G2 289 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR56A3Q8NH54 315 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TIGARQ9NQ88 270 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FEZF1A0PJY2 475 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FGF4P08620 206 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OXTRP30559 389 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GPR150Q8NGU9 434 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GXYLT2A0PJZ3 443 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A31A6NKX4 558 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 H3BSH0 61 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SCO2O43819 266 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFV2P19404 249 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PER3P56645 1201 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 RPS26P62854 115 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GAS6Q14393 721 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SPHARQ15513 63 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NNATQ16517 81 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LIPKQ5VXJ0 399 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF283Q8N7M2 679 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF565Q8N9K5 539 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms