RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.13□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 GTF3C1Q12789 2109 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0A6YYD5 115 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 A8MT66 165 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 SEMA3DO95025 777 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 CLDN1O95832 211 aa7.12□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF24P17028 368 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TNNI3P19429 210 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.278e-9■■□□□ 13.4
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SGMS1-201ENST00000361543 CENPHQ9H3R5 247 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.12□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 A8MVJ9 347 aa7.11□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8RI6L899 631 aa7.11□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TM9SF1O15321 606 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PROM1O43490 865 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 DYRK3O43781 588 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TMPRSS11DO60235 418 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PLIN3O60664 434 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SLC19A2O60779 497 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 WISP2O76076 250 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR6B1O95007 311 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZWINTO95229 277 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 AIFM1O95831 613 aa7.11□□□□□ -1.27
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