RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A13Q96H72 371 aa15.61■□□□□ 0.09
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SH3BP4-201ENST00000344528 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.58■□□□□ 0.09
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SH3BP4-201ENST00000344528 HCSTQ9UBK5 93 aa15.58■□□□□ 0.09
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