RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323929.7

MRE11-201, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRE11, Length 6,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-201ENST00000323929 LCN8Q6JVE9 175 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ANKFN1Q8N957 763 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 OR2L5Q8NG80 312 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 FKBP7Q9Y680 259 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 RNF13O43567 381 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 C1orf105O95561 183 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 CSTAP01040 98 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 TOR3AQ9H497 397 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 POT1Q9NUX5 634 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.2□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 PRODHO43272 600 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 TBX10O75333 385 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 CDH11P55287 796 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SCN1BQ07699 218 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SEMA3BQ13214 749 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 PMS2P3Q13401 168 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 CCINQ13939 588 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 PERM1Q5SV97 790 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 RAB43Q86YS6 212 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 OR8K5Q8NH50 307 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ARMC5Q96C12 935 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 DDIT4LQ96D03 193 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 GINS4Q9BRT9 223 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 CLEC3AO75596 197 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SLC16A8O95907 504 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ITIH1P19827 911 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ACTC1P68032 377 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ACTA1P68133 377 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 BCL7AQ4VC05 210 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 IDNKQ5T6J7 187 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SATL1Q86VE3 508 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 TDHQ8IZJ6 230 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 PGBD5Q8N414 524 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 RAB8BQ92930 207 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 FAM129BQ96TA1 746 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 TUBA1BP68363 451 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SHC2P98077 582 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SLC36A3Q495N2 470 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 HSDL2Q6YN16 418 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 TUBA1AQ71U36 451 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 TREML1Q86YW5 311 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ARRDC3Q96B67 414 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 GJE1A6NN92 205 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 E2F3O00716 465 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 PHYHO14832 338 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 AREL1O15033 823 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 SGSHP51688 502 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 EFR3AQ14156 821 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ZNF773Q6PK81 442 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 KAT2AQ92830 837 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 APIPQ96GX9 242 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 AURKAO14965 403 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ARL6IP5O75915 188 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 MT-ND5P03915 603 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 HTR1AP08908 422 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 CD36P16671 472 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ACSL1P33121 698 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 MAGEA3P43357 314 aa7.19□□□□□ -1.26
MRE11-201ENST00000323929 ZNF84P51523 738 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms