RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299353.6

BORCS7-ASMT-201, Transcript of BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene BORCS7-ASMT, Length 2,670 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.65□□□□□ -1.35
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.64□□□□□ -1.35
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IRF3Q14653 427 aa6.64□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.64□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 VMACQ2NL98 169 aa6.64□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.64□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.64□□□□□ -1.35
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