RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM10Q96HG1 83 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DAPP1Q9UN19 280 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPR1 153 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C76A6NM76 312 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF223E7ERA6 249 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf97H3BN30 126 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC7O00311 574 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LIASO43766 372 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC3AO75596 197 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FESP07332 822 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO45P0C2W1 286 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 POU2F1P14859 743 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GNAZP19086 355 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ARNTP27540 789 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 THBS2P35442 1172 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT3P56703 355 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 IL2P60568 153 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH1Q08174 1060 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TNK1Q13470 666 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS6KA2Q15349 733 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NTRK2Q16620 822 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 BEX5Q5H9J7 111 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LIPNQ5VXI9 398 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 AADACL2Q6P093 401 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 AAGABQ6PD74 315 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CES3Q6UWW8 571 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 VSTM4Q8IW00 320 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2L5Q8NG80 312 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG3Q92685 438 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NEIL2Q969S2 332 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PYCR2Q96C36 320 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL8Q96CD0 374 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 BEX2Q9BXY8 128 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 REG4Q9BYZ8 158 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LYRM4Q9HD34 91 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX15Q9NRS6 342 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SYBUQ9NX95 663 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FETUBQ9UGM5 382 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DSCAMO60469 2012 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LRIT2A6NDA9 550 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10H2O60403 315 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSL3O95573 720 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CPN1P15169 458 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TPSB2P20231 275 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 STT3AP46977 705 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNC1P48547 511 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HNMTP50135 292 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G16P53816 162 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LIM2P55344 173 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GPS1Q13098 491 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RUNX2Q13950 521 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SETDB1Q15047 1291 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TPSAB1Q15661 275 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.18□□□□□ -1.26
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