RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 C6P13671 934 aa26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 HOXD12P35452 270 aa26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 GSTM5P46439 218 aa26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 RPA4Q13156 261 aa26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 SEC23BQ15437 767 aa26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 CASP12Q6UXS9 341 aa26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 AIF1LQ9BQI0 150 aa26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 MND1Q9BWT6 205 aa26.58■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 TMEM165Q9HC07 324 aa26.58■■□□□ 1.85
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UBP1-201ENST00000283628 OR10H3O60404 316 aa26.58■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
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UBP1-201ENST00000283628 KCNJ5P48544 419 aa26.58■■□□□ 1.84
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UBP1-201ENST00000283628 TMIEQ8NEW7 156 aa26.58■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
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UBP1-201ENST00000283628 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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UBP1-201ENST00000283628 C11orf96Q7Z7L8 435 aa26.56■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CLIP4Q8N3C7 705 aa26.56■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 OR5AR1Q8NGP9 310 aa26.56■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 HERVK_113Q902F9 699 aa26.56■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 ARRDC3Q96B67 414 aa26.56■■□□□ 1.84
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UBP1-201ENST00000283628 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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UBP1-201ENST00000283628 ANKRD53Q8N9V6 530 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 PROKR2Q8NFJ6 384 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 SETD6Q8TBK2 473 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 OR8D1Q8WZ84 308 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 RAB8BQ92930 207 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CNPPD1Q9BV87 410 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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