RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267260.4

SRRM4-201, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRM4, Length 8,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4-201ENST00000267260 PRODH2Q9UF12 536 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 RTTNQ86VV8 2226 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 SLC31A1O15431 190 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 ECI2O75521 394 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 DCUN1D4Q92564 292 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 KCNJ9Q92806 393 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 VPS25Q9BRG1 176 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF30P17039 623 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FOXK1P85037 733 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TMEM225Q6GV28 225 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 EPGNQ6UW88 154 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TAAR8Q969N4 342 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 GJE1A6NN92 205 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 SP3Q02447 781 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 PNCKQ6P2M8 343 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 SSX9Q7RTT3 188 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 MAGIXQ9H6Y5 334 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 SLC35F4A4IF30 521 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 F5H5P2 479 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 EMX2Q04743 252 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 OR8K5Q8NH50 307 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FCRL5Q96RD9 977 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 DERL2Q9GZP9 239 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 RRAGCQ9HB90 399 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FAAHO00519 579 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CD9P21926 228 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CHRNA4P43681 627 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FGFBP1Q14512 234 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 ARL6IP1Q15041 203 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 GRIK5Q16478 980 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 BCL2L15Q5TBC7 163 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 GKN2Q86XP6 184 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 OR10T2Q8NGX3 314 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 SNAPC3Q92966 411 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 GLYATL1Q969I3 302 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF286AQ9HBT8 521 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FUT10Q6P4F1 479 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 OR5AK3PQ8NH89 298 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TRPM6Q9BX84 2022 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 A0A1W2PPW3 197 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 IRF9Q00978 393 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF425Q6IV72 752 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 NTAN1Q96AB6 310 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 PYCR2Q96C36 320 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 PSD2Q9BQI7 771 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 D6RAR5 112 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 CHRNA1P02708 482 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 HOXA9P31269 272 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 AKR1C2P52895 323 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 GALK2Q01415 458 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 PPA1Q15181 289 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FBXL20Q96IG2 436 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 H3BSH0 61 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 MPP7Q5T2T1 576 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 PHF19Q5T6S3 580 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 USP51Q70EK9 711 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FKBP10Q96AY3 582 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRM4-201ENST00000267260 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms