RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GVI7 797 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 AIPO00170 330 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CCL22O00626 93 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SGCEO43556 437 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 IL1AP01583 271 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SCG5P05408 212 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LINC00271P0C7V0 271 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 IRF1P10914 325 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 APEX1P27695 318 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 NUDT6P53370 316 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CAMK2DQ13557 499 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF628Q5EBL2 1059 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 IL31Q6EBC2 164 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF605Q86T29 641 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TRIM69Q86WT6 500 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 NANPQ8TBE9 248 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 UCK1Q9HA47 277 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HHATLQ9HCP6 504 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.89■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 FAM74A7A6NL05 159 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LGALS8O00214 317 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ADRB1P08588 477 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 FAM74A3Q4VXF1 159 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HES5Q5TA89 166 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 NETO1Q8TDF5 533 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SPG21Q9NZD8 308 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SH3BP4Q9P0V3 963 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 KCTD3Q9Y597 815 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 MYO7AQ13402 2215 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CRCPO75575 148 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SMIM6P0DI80 62 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CRYBB2P43320 205 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 MPEG1Q2M385 716 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 GANCQ8TET4 914 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CHTF18Q8WVB6 975 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 MNTQ99583 582 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ANKRA2Q9H9E1 313 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PRDM9Q9NQV7 894 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.88■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PDCD5O14737 125 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TSPAN3O60637 253 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ALDH9A1P49189 494 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SLC11A2P49281 568 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CYP4F8P98187 520 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 RELQ04864 619 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SCMH1Q96GD3 660 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CXorf58Q96LI9 332 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TAS2R16Q9NYV7 291 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HYKKA2RU49 373 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SLC28A1O00337 649 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 DNASE1P24855 282 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TWF1Q12792 350 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LCP2Q13094 533 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SGCAQ16586 387 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TPGS2Q68CL5 300 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 KRT74Q7RTS7 529 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SLC22A12Q96S37 553 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 IKZF5Q9H5V7 419 aa20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 GFRA2O00451 464 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ARSDP51689 593 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 C12orf40Q86WS4 652 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms