RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 ELMOD3Q96FG2 381 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 C5orf30Q96GV9 206 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NSMCE3Q96MG7 304 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 INTS14Q96SY0 518 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CDRT15Q96T59 188 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 GFI1Q99684 422 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SLC25A23Q9BV35 468 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CALN1Q9BXU9 219 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 RTN4RQ9BZR6 473 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 FAM192AQ9GZU8 254 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 VCX2Q9H322 139 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CENPHQ9H3R5 247 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ECT2Q9H8V3 914 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 FGF22Q9HCT0 170 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 LZTFL1Q9NQ48 299 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 HACD3Q9P035 362 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SLC22A14Q9Y267 594 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 USP16Q9Y5T5 823 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ELP1O95163 1332 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ACEP12821 1306 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NPATQ14207 1427 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ADCY9O60503 1353 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 A0A087X002 238 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM120BA0PK00 339 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OR2M5A3KFT3 312 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OR2A25A4D2G3 310 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 BTBD17A6NE02 478 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OOEPA6NGQ2 149 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 J3QR06 171 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PSMD11O00231 422 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 AKR7A2O43488 359 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NDUFA2O43678 99 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MGRN1O60291 552 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ECE2O60344 883 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 STX10O60499 249 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 DNAJB6O75190 326 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CRLF1O75462 422 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TGM6O95932 706 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CEACAM1P13688 526 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 EPORP19235 508 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CALB2P22676 271 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ACADLP28330 430 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 GPR143P51810 404 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CDH8P55286 799 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PRMT2P55345 433 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MAB21L1Q13394 359 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PON2Q15165 354 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MEP1AQ16819 746 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PARP6Q2NL67 630 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 RAET1GQ6H3X3 334 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ADCK2Q7Z695 626 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ISCA2Q86U28 154 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ERICH1Q86X53 443 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF573Q86YE8 665 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SLC38A6Q8IZM9 456 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TRPV3Q8NET8 790 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OR2T12Q8NG77 320 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CFAP61Q8NHU2 1237 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 RASD2Q96D21 266 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TMCO6Q96DC7 493 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MAGED4Q96JG8 741 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CEP170P1Q96L14 293 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NSMCE2Q96MF7 247 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NECTIN4Q96NY8 510 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 DGAT2Q96PD7 388 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OPALINQ96PE5 141 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 DHRS9Q9BPW9 319 aa2.74□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms