RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259607.6

CCL21-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 21, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL21, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21-201ENST00000259607 GABRR3A8MPY1 467 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TMEM114B3SHH9 223 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 PPP6CO00743 305 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TMPRSS11DO60235 418 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 FGF17O60258 216 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 WISP1O95388 367 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 AIFM1O95831 613 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 WDPCPO95876 746 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 PRPH2P23942 346 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SERPINB4P48594 390 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SSR4P51571 173 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 XKP51811 444 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 EFNA3P52797 238 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 MLF1P58340 268 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 HHATQ5VTY9 493 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 C18orf63Q68DL7 685 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 OPN5Q6U736 354 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 HDXQ7Z353 690 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 BEST3Q8N1M1 668 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SLC15A4Q8N697 577 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 BCORP1Q8N888 145 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 NCLNQ969V3 563 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ERP27Q96DN0 273 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ACPTQ9BZG2 426 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 C1orf109Q9NX04 203 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TIMM22Q9Y584 194 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 A0A1B0GTL3 188 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 MASP2O00187 686 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SEC22BO75396 215 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 RASAL1O95294 804 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 HSPA4LO95757 839 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 GBAP04062 536 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SERPINE1P05121 402 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 CELA2AP08217 269 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 MPIP34949 423 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ASMTP46597 345 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 CD97P48960 835 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ALDH9A1P49189 494 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 HLCSP50747 726 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 NRG3P56975 720 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 FOXK1P85037 733 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TUBA3CQ13748 450 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 CASP8Q14790 479 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 OR1C1Q15619 314 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 MPEG1Q2M385 716 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ZNF766Q5HY98 468 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 KANK2Q63ZY3 851 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 DDIASQ8IXT1 998 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TAGAPQ8N103 731 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 NUBPLQ8TB37 319 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 ASB15Q8WXK1 588 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 KLHL29Q96CT2 875 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 SGCZQ96LD1 299 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL21-201ENST00000259607 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms