RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arhgap19Q8BRH3 494 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CrtapQ9CYD3 400 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Grb14Q9JLM9 538 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm6401L7N2C0 213 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ifi204P0DOV2 619 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CfpP11680 464 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ap3s2Q8BSZ2 193 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pink1Q99MQ3 580 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Otub2Q9CQX0 234 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dsn1Q9CYC5 348 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plod2Q9R0B9 737 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mamld1P0C6A2 803 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf157Q3TEL6 685 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm14226Q3TZL0 686 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nxf3Q4ZGD9 553 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Phc1Q64028 1012 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pum2Q80U58 1066 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdhr5Q8VHF2 831 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trmt10bQ9D075 318 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prl8a6Q9DAY2 240 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myh8P13542 1937 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anxa3O35639 323 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf215Q5SPX3 379 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1087Q7TR63 313 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MaobQ8BW75 520 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rhbdl1Q8VC82 373 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Asgr1P34927 284 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kir3dl1P83555 432 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kcnab3P97382 249 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Them4Q3UUI3 230 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fzd10Q8BKG4 582 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ing4Q8C0D7 249 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NeproQ8R2U2 564 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wdr54Q9R0D8 334 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm11239E9Q5Z9 360 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm11237F2Z3W5 360 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm11238F2Z478 360 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arl9F7BE40 171 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tspan6O70401 245 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MbP04247 154 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hif3aQ0VBL6 662 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdk10Q3UMM4 360 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Acsm3Q3UNX5 580 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm428Q3UTE2 360 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kansl1Q80TG1 1036 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arhgap8Q9CXP4 425 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dennd6bQ9D9V7 585 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Leng1Q9DB98 261 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tcte1A6H639 498 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 BC049352E9Q2Z6 85 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gjd2O54851 321 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rps26P62855 115 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddr1Q03146 911 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr524Q7TRU0 318 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stard5Q9EPQ7 213 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tpk1Q9R0M5 243 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CerklA2AQH1 525 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ZxdbA2CE44 873 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LdlrP35951 862 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cnot4Q8BT14 575 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mchr1Q8JZL2 353 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mageh1Q9NWG9 218 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 A0A286YDP4 300 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 McidasQ3UZ45 379 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lpcat4Q6NVG1 524 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Syt16Q7TN83 639 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc35e2Q8C811 405 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ApmapQ9D7N9 415 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdh20Q9Z0M3 801 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tcf7l1Q9Z1J1 584 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc1a5P51912 553 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atf7ip2Q3UL97 452 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp30Q3UN04 517 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spata13Q5DU57 656 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc35g3Q5F297 340 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsf5Q5ND04 624 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rab28Q99KL7 221 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 OxsmQ9D404 459 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TyrP11344 533 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MazP56671 477 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dtx3lQ3UIR3 748 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Paqr3Q6TCG8 311 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mfsd8Q8BH31 519 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smurf2A2A5Z6 748 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ralgps1A2AR50 585 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 UprtB1AVZ0 310 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr31E9Q3K2 317 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc16a3P57787 470 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tgtp2Q3T9E4 415 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 OgnQ62000 298 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tgtp1Q62293 415 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf182Q6P560 627 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AdprhP54923 362 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Igsf9Q05BQ1 1179 aa16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms