RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635835.1

CACNB4-215, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5

Gene CACNB4, Length 1,807 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-215	ENST00000635835	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	DHODH	Q02127	395 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	TWF1	Q12792	350 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	DAG1	Q14118	895 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	IMPG1	Q17R60	797 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CBWD6	Q4V339	395 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SYTL3	Q4VX76	610 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CD276	Q5ZPR3	534 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SAXO2	Q658L1	398 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CASP12	Q6UXS9	341 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	PIGZ	Q86VD9	579 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ACTL9	Q8TC94	416 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CPNE1	Q99829	537 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SARG	Q9BW04	601 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ITPA	Q9BY32	194 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	MED28	Q9H204	178 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	MUC13	Q9H3R2	512 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	LHX9	Q9NQ69	397 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835		A0A0G2JLW4	131 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835		A6NIZ1	184 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SYT5	O00445	386 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CXCL11	O14625	94 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SUV39H1	O43463	412 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	XPNPEP2	O43895	674 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	KDM4B	O94953	1096 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	LDLR	P01130	860 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	PTGER2	P43116	358 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	FMO5	P49326	533 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	FHIT	P49789	147 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CTSC	P53634	463 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CD47	Q08722	323 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CNTN1	Q12860	1018 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	MED22	Q15528	200 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZNF79	Q15937	498 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	IL17A	Q16552	155 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	LCN8	Q6JVE9	175 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	POT1	Q9NUX5	634 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	PNPO	Q9NVS9	261 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	AURKC	Q9UQB9	309 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	RNF6	Q9Y252	685 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	C7orf66	A4D0T2	115 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	DISC1	C4P0D8	188 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	MLYCD	O95822	493 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ONECUT2	O95948	504 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	ADA	P00813	363 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	IFNA17	P01571	189 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CACNB4-215	ENST00000635835	NR3C1	P04150	777 aa		7.54	□□□□□ -1.2

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