RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 FANCEQ9HB96 536 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 OLAHQ9NV23 265 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CDC14CA4D256 554 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CDH1P12830 882 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 STX1BP61266 288 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HPCAP84074 193 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 DNASE1L3Q13609 305 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 BORAQ6PGQ7 559 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM47BQ8NA70 645 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SMPDL3AQ92484 453 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PTERQ96BW5 349 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC45A3Q96JT2 553 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PARVBQ9HBI1 364 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 A6NL46 340 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 P2RX6O15547 441 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 STAMBPO95630 424 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H2ADP20671 130 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4D1Q15615 310 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CPZQ66K79 652 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 UGT3A1Q6NUS8 523 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ISCA2Q86U28 154 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4K3Q96R72 315 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 AKTIPQ9H8T0 292 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PNPLA3Q9NST1 481 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A14Q9Y267 594 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF860A6NHJ4 632 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC14BA6NHZ5 514 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 H0YGG7 62 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 H0YJX3 145 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BNH8 94 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EM74 188 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PDLIM1O00151 329 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 NME4O00746 187 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 GNAO1P09471 354 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 IMPDH1P20839 514 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ADRM1Q16186 407 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2A13Q16696 494 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 MAJINQ3KP22 176 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB42Q8N4Z0 105 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 KCT2Q8NC54 265 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 CTSFQ9UBX1 484 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 OTX2P32243 289 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXA1P55317 472 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC50Q53HI1 259 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 KMT5CQ86Y97 462 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A11Q9NSA0 550 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRK2Q5S007 2527 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0G2JN53 185 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms