RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM63AO94886 807 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC2A10O95528 541 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3-9P01782 118 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV4-34P06331 123 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINGO3P0C6S8 592 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNH1P13489 461 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CYP11B1P15538 503 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PFKFB1P16118 471 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 LONP1P36776 959 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ID1P41134 155 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 GARSP41250 739 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RXRGP48443 463 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NRIP1P48552 1158 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ASCL1P50553 236 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CNTN1Q12860 1018 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 LCP2Q13094 533 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 UNC119Q13432 240 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 BIRC3Q13489 604 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SERTAD2Q14140 314 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 BECN1Q14457 450 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PTGISQ16647 500 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM83EQ2M2I3 478 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF674Q2M3X9 581 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CBWD6Q4V339 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABCA11PQ4W5N1 156 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGSF11Q5DX21 431 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CBWD3Q5JTY5 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PLPP4Q5VZY2 271 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TTC27Q6P3X3 843 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 IKBIPQ70UQ0 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF429Q86V71 674 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NLRP14Q86W24 1093 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MFN1Q8IWA4 741 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 GCNT2Q8N0V5 402 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ESX1Q8N693 406 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SAMD3Q8N6K7 520 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SUMF2Q8NBJ7 301 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZBTB44Q8NCP5 570 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2L8Q8NGY9 312 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RFFLQ8WZ73 363 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SMPDL3AQ92484 453 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RDH5Q92781 318 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NXNL1Q96CM4 212 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPATA17Q96L03 361 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINC00477Q96M19 166 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CPNE1Q99829 537 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPNS1Q9H2V7 528 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 Q9H3A6 140 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 IL1RL2Q9HB29 575 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MMP26Q9NRE1 261 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 IRAK4Q9NWZ3 460 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCML2Q9UQR0 700 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 BAHCC1Q9P281 2608 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 HEG1Q9ULI3 1381 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 A6NDX4 124 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 A6NLC8 198 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 C16orf90A8MZG2 172 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 WWP2O00308 870 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC17A2O00624 439 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR7A17O14581 309 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 BBOX1O75936 387 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SUPT7LO94864 414 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLITRK3O94933 977 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PENKP01210 267 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PYGLP06737 847 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 LAMP2P13473 410 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACP1P24666 158 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCNCP24863 283 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TM4SF1P30408 202 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TFPI2P48307 235 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGDIBP52566 201 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 GGTLC2Q14390 218 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 BRD3Q15059 726 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 RBBP7Q16576 425 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSTQ16762 297 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 GALNT17Q6IS24 598 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PIGWQ7Z7B1 504 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TTC5Q8N0Z6 440 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 C6orf223Q8N319 242 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 Q8N9W7 124 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR10H4Q8NGA5 316 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBALD1Q8TB05 177 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 LPGAT1Q92604 370 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 USP6NLQ92738 828 aa-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms