RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	KLK1	P06870	262 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	HSD3B1	P14060	373 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	HSD3B2	P26439	372 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CD96	P40200	585 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	STT3A	P46977	705 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	GPR143	P51810	404 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	NAGLU	P54802	743 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	MLF1	P58340	268 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	PLIN5	Q00G26	463 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	OR1C1	Q15619	314 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CFAP157	Q5JU67	520 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	HBEGF	Q99075	208 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	RAB21	Q9UL25	225 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	DYRK3	O43781	588 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ZFAND5	O76080	213 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	TUBB	P07437	444 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	NR6A1	Q15406	480 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF766	Q5HY98	468 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	BCORP1	Q8N888	145 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	MDS2	Q8NDY4	140 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	AGAP11	Q8TF27	550 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	OXSM	Q9NWU1	459 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	GLOD5	A6NK44	160 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469		H3BQF6	201 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	GPR75	O95800	540 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	DDAH2	O95865	285 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CD46	P15529	392 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	MAPK12	P53778	367 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	LIPM	Q5VYY2	423 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	HSDL2	Q6YN16	418 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	BANP	Q8N9N5	519 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	FAR1	Q8WVX9	515 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	C5orf34	Q96MH7	638 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	LRFN1	Q9P244	771 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	PLLP	Q9Y342	182 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	TIMM22	Q9Y584	194 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	OR10H2	O60403	315 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	GUCY1B2	O75343	617 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	RASAL1	O95294	804 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CYB561	P49447	251 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	HTR6	P50406	440 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	SPINK14	Q6IE38	97 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ART5	Q96L15	291 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	KCNA7	Q96RP8	456 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	SMC6	Q96SB8	1091 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ACPT	Q9BZG2	426 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	OLAH	Q9NV23	265 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CRCP	O75575	148 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	NEURL1	O76050	574 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CBX6	O95503	412 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CHN1	P15882	459 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	HLCS	P50747	726 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	PCLAF	Q15004	111 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	OR8K3	Q8NH51	312 aa		18.66	■□□□□ 0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms