RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 HYAL4Q2M3T9 481 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 EMC4Q5J8M3 183 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 LIPJQ5W064 366 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 GK5Q6ZS86 529 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 RNF175Q8N4F7 328 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 NUBPLQ8TB37 319 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 C14orf79Q96F83 325 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 DGAT2Q96PD7 388 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 FAM173AQ9BQD7 235 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 TTTY12Q9BZ98 90 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 DMRT3Q9NQL9 472 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PHF11Q9UIL8 331 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 H0YIV9 168 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 UGDHO60701 494 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PDE9AO76083 593 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 IGHG3P01860 377 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 TNFRSF17Q02223 184 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PLGLB1Q02325 96 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ACAP2Q15057 778 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.38e-8■■■■□ 21.6
CTIF-206ENST00000588345 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PIGGQ5H8A4 983 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 GPR180Q86V85 440 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 SLC22A16Q86VW1 577 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 FAM109AQ8N4B1 249 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ASB5Q8WWX0 329 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 TANKQ92844 425 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 GPR78Q96P69 363 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 CENPKQ9BS16 269 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 IL1RL2Q9HB29 575 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 SNX15Q9NRS6 342 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 SACM1LQ9NTJ5 587 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PSD3Q9NYI0 1048 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 HCFC1P51610 2035 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 A0A1B0GVC2 190 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 FAM166BA8MTA8 275 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 KLHL2O95198 593 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 RAP1GDS1P52306 607 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PLIN5Q00G26 463 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 FOLH1Q04609 750 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 FOXO1Q12778 655 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 MROH9Q5TGP6 573 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 FBXL20Q96IG2 436 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ART5Q96L15 291 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ACTR8Q9H981 624 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 PRM3Q9NNZ6 103 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 SH2D2AQ9NP31 389 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 RNF6Q9Y252 685 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ATG4BQ9Y4P1 393 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-206ENST00000588345 A0A096LPK6 155 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 OR14I1A6ND48 311 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 G3V3Y1 287 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 PROM1O43490 865 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 DYRK3O43781 588 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 CCL3P10147 92 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 GFAPP14136 432 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 IGFBP2P18065 325 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 CHRNB4P30926 498 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 BSGP35613 385 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 PHEXP78562 749 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 ASPHQ12797 758 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 CUL3Q13618 768 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 PFKFB4Q16877 469 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 GXYLT1Q4G148 440 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 C18orf63Q68DL7 685 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 LYPD8Q6UX82 237 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-206ENST00000588345 FAM47EQ6ZV65 393 aa16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms