RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD300AQ9UGN4 299 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS20P59510 1910 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLIC1O00299 241 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHST10O43529 356 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GFRA3O60609 400 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPN6P29350 595 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOAT1P35610 550 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERFP50548 548 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 EMP3P54852 163 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPB3Q12988 150 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR6C1Q96RD1 312 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CES1P1Q9UKY3 287 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNX8Q9Y5X2 465 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPTBP11277 2137 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 STAMBPO95630 424 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOX11P35716 441 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB38P57729 211 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 C16orf72Q14CZ0 275 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC116Q8IYX3 515 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLEC4FQ8N1N0 589 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 HIPK4Q8NE63 616 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10A6Q8NH74 314 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFP28Q8NHY6 868 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHAC1Q9H158 963 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 RARRES3Q9UL19 164 aa16.25■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFCAB7A8K855 629 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM227AF5H4B4 570 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 H3BMH7 237 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 NTRK1P04629 796 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPC1P35052 558 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSK3BP49841 420 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARSFP54793 590 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4K14Q8NGD5 310 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5AK3PQ8NH89 298 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PEX11GQ96HA9 241 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHF12Q96QT6 1004 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCN2AQ99250 2005 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMKLR1Q99788 373 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 YIPF2Q9BWQ6 316 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPT1P8Q9HAU6 139 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF292O60281 2723 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF749O43361 778 aa16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENTPD5O75356 428 aa16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT-CO3P00414 261 aa16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSD17B1P14061 328 aa16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 MPIP34949 423 aa16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 MS4A2Q01362 244 aa16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAB1Q13480 694 aa16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 FLOT2Q14254 428 aa16.23■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYT16Q17RD7 645 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms