RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 TANKQ92844 425 aa7.55□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.55□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 EBF4Q9BQW3 602 aa7.55□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.55□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 GDF1P27539 372 aa7.55□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 SCTRP47872 440 aa7.55□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 VRK3Q8IV63 474 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 174
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SENP1-210ENST00000552189 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 H7C0S8 307 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 MYL12BO14950 172 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 CLOCKO15516 846 aa7.54□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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