RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 ZNF595Q8IYB9 648 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SLC5A11Q8WWX8 675 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 GNRHR2Q96P88 292 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 G6PC3Q9BUM1 346 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 IL22Q9GZX6 179 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PARVBQ9HBI1 364 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 A8MV72 311 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 LIASO43766 372 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 GPRIN2O60269 458 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 CTNSO60931 367 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SERPINA6P08185 405 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 FBXO45P0C2W1 286 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 CERS1P27544 350 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 LIM2P55344 173 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 CSHL1Q14406 222 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ZNF470Q6ECI4 717 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 NEPROQ6NW34 567 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 TRPV3Q8NET8 790 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 TMEM171Q8WVE6 324 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 MS4A6EQ96DS6 147 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ZNF597Q96LX8 424 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 MED18Q9BUE0 208 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 CNIH4Q9P003 139 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SOX13Q9UN79 622 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 DTX4Q9Y2E6 619 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 URADA6NGE7 173 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ERI3O43414 337 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 IGKV3-11P04433 115 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 CETN2P41208 172 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 NPY2RP49146 381 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PGGT1BP53609 377 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 16.3
CS-230ENST00000551968 BBS9Q3SYG4 887 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 VWA1Q6PCB0 445 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 LRRC57Q8N9N7 239 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 NUBPLQ8TB37 319 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SLC22A8Q8TCC7 542 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ZPLD1Q8TCW7 415 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 GAL3ST3Q96A11 431 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ZNF226Q9NYT6 803 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 BFARQ9NZS9 450 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PACSIN3Q9UKS6 424 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 C15orf41Q9Y2V0 281 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 EXPH5Q8NEV8 1989 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 A0A1W2PNV4 684 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 GRID2IPA4D2P6 1211 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 CTAGE9A4FU28 777 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PFDN6O15212 129 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 C8GP07360 202 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 CYP4B1P13584 511 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 STIP1P31948 543 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SLC1A2P43004 574 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PLA2G16P53816 162 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SRYQ05066 204 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 STX4Q12846 297 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SNX1Q13596 522 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 RCAN2Q14206 197 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 DUPD1Q68J44 220 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ANKRD34AQ69YU3 496 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ADNP2Q6IQ32 1131 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 TMPRSS11BQ86T26 416 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 TBC1D19Q8N5T2 526 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 C1orf54Q8WWF1 131 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 ATL1Q8WXF7 558 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 DIO2Q92813 273 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 FAR2Q96K12 515 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 RILPQ96NA2 401 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PIGMQ9H3S5 423 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 CLCF1Q9UBD9 225 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 IKZF3Q9UKT9 509 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 DAPP1Q9UN19 280 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 TENM1Q9UKZ4 2725 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 PRR14LQ5THK1 2151 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 TGP01266 2768 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 LRIT2A6NDA9 550 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 B3GALT2O43825 422 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP12.41□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 HAUS5O94927 633 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 TGM6O95932 706 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 THBDP07204 575 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-230ENST00000551968 UGT2B10P36537 528 aa12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms