RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D16Q8TBP0 767 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PHYHIPQ92561 330 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IGSF8Q969P0 613 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TOP1MTQ969P6 601 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXL8Q96CD0 374 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OTUB2Q96DC9 234 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM20AQ96MK3 541 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GUCD1Q96NT3 240 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TECTBQ96PL2 329 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PNKPQ96T60 521 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OLFM1Q99784 485 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CMKLR1Q99788 373 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MLST8Q9BVC4 326 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM39BQ9GZU3 492 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTL8Q9H568 366 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ELOVL6Q9H5J4 265 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH20Q9HBT6 801 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PXMP2Q9NR77 195 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARL15Q9NXU5 204 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AHSPQ9NZD4 102 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GRHL1Q9NZI5 618 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PISDQ9UG56 409 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FZD1Q9UP38 647 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 WDR45Q9Y484 360 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CLIC4Q9Y696 253 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CUX2O14529 1486 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PLB1Q6P1J6 1458 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EMSYQ7Z589 1322 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA6L10A6NI86 522 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MS4A18H0YCH9 400 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 H0YIG0 161 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IFNL4K9M1U5 179 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HAS3O00219 553 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR171O14626 319 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IDH3BO43837 385 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMPRSS11DO60235 418 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SCN2BO60939 215 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TM7SF2O76062 418 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF8O76064 485 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NOL4O94818 638 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SEMA3DO95025 777 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2T7P0C7T2 308 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HSMCR30P0CW71 290 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CEACAM1P13688 526 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CREB1P16220 341 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TPSB2P20231 275 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EDN2P20800 178 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP3A5P20815 502 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PROZP22891 400 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP2C18P33260 490 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC1A4P43007 532 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGEA11P43364 429 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CASP4P49662 377 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CXCR3P49682 368 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TPMTP51580 245 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CCL11P51671 97 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SOX10P56693 466 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms