RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 SDHBP21912 280 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 VPS35Q96QK1 796 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 SLC22A4Q9H015 551 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 HSPB11Q9Y547 144 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 SOX14O95416 240 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 CLDN9O95484 217 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 MSL3P1P0C860 447 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 ASAH1Q13510 395 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 TESCQ96BS2 214 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 GON7Q9BXV9 100 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.7□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 OR2B3O76000 313 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 CCNB2O95067 398 aa8.69□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 PRAMEF1O95521 474 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PSKH1P11801 424 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ETFAP13804 333 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 BPIP17213 487 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 AMD1P17707 334 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 CD9P21926 228 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ALAS2P22557 587 aa8.69□□□□□ -1.02
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