RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 ASIC1P78348 528 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 NR1D2Q14995 579 aa3.1□□□□□ -1.91
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PTPRK-220ENST00000531466 C4orf45Q96LM5 186 aa3.1□□□□□ -1.91
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PTPRK-220ENST00000531466 TRPV2Q9Y5S1 764 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 LNP1A1A4G5 178 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 SYCE3A1L190 88 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 A8MXE2 369 aa3.08□□□□□ -1.92
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