RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PUF60-213	ENST00000528999	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PUF60-213	ENST00000528999	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PUF60-213	ENST00000528999	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PUF60-213	ENST00000528999	ASB4	Q9Y574	426 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PUF60-213	ENST00000528999	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PUF60-213	ENST00000528999	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PUF60-213	ENST00000528999	ALPK3	Q96L96	1907 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	FEZF1	A0PJY2	475 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	HMGN4	O00479	90 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	ASNA1	O43681	348 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	XPNPEP2	O43895	674 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	PCDHGA12	O60330	932 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	INMT	O95050	263 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	AGR2	O95994	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	GABRB1	P18505	474 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	HTR1B	P28222	390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	FMO3	P31513	532 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	MPI	P34949	423 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	KRT20	P35900	424 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	UGT2B10	P36537	528 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	SERPINB10	P48595	397 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	KHK	P50053	298 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	CDC42	P60953	191 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	CYP4F2	P78329	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	OLR1	P78380	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	OCA2	Q04671	838 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	SLAMF1	Q13291	335 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	ILK	Q13418	452 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	LRRC32	Q14392	662 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	NFATC4	Q14934	902 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	KIR2DS3	Q14952	304 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	NDUFA9	Q16795	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	NT5C	Q8TCD5	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	FGF14	Q92915	247 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	SLC38A4	Q969I6	547 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TMEM19	Q96HH6	336 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999		Q96MT0	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	BBS4	Q96RK4	519 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	CSF3R	Q99062	836 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	CERS4	Q9HA82	394 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	KCNK6	Q9Y257	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	COL4A3	Q01955	1670 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999		A0A1W2PQF6	199 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999		A0A1W2PRQ8	180 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	PRSS38	A1L453	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	OR2A25	A4D2G3	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	URAD	A6NGE7	173 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	ZAR1L	A6NP61	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	EMC8	O43402	210 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PUF60-213	ENST00000528999	TNFSF14	O43557	240 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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