RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 ADAM8P78325 824 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 MGAT5Q09328 741 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 DOC2AQ14183 400 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 SLC15A4Q8N697 577 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 MBD6Q96DN6 1003 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 WDR34Q96EX3 536 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 LRRC46Q96FV0 321 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-210ENST00000527027 DVL2O14641 736 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 LAPTM5Q13571 262 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 LYPD8Q6UX82 237 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SH3GL2Q99962 352 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DERL2Q9GZP9 239 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PROK2Q9HC23 129 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 WWOXQ9NZC7 414 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CNIH4Q9P003 139 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 VPS13CQ709C8 3753 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 AHRRA9YTQ3 701 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DYRK3O43781 588 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 STK16O75716 305 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 EPPINO95925 133 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 IGKV3-11P04433 115 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DRD2P14416 443 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CD22P20273 847 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 BMP5P22003 454 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CPN2P22792 545 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 STT3AP46977 705 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 HSPA7P48741 367 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ASCL1P50553 236 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 BIKQ13323 160 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MORF4L2Q15014 288 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 GPSM1Q86YR5 675 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 LIX1Q8N485 282 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SNX31Q8N9S9 440 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ESAMQ96AP7 390 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DGAT2Q96PD7 388 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MS4A8Q9BY19 250 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 CBLCQ9ULV8 474 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FGF17O60258 216 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SCELO95171 688 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FBXO45P0C2W1 286 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 MSH2P43246 934 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TRPC1P48995 793 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 SLC12A2P55011 1212 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 IRF8Q02556 426 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TBCCQ15814 346 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms