RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 MKL2Q9ULH7 1088 aa13.5□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.5□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 A0A1W2PP18 115 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 GLOD5A6NK44 160 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 FAM227AF5H4B4 570 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 NR5A2O00482 541 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 EBAG9O00559 213 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PGRMC2O15173 223 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PDPK1O15530 556 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 OR10H2O60403 315 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 BRINP1O60477 761 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 SLITRK5O94991 958 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 LIPCP11150 499 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PORP16435 677 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 FOLR3P41439 243 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 MANFP55145 182 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 KRT72Q14CN4 511 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 NCF4Q15080 339 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 MAPKAPK3Q16644 382 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 VWA2Q5GFL6 755 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 COX15Q7KZN9 410 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 OR7A2PQ8NGA2 310 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 NACC2Q96BF6 587 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ITCHQ96J02 903 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 CSF3RQ99062 836 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ASCL3Q9NQ33 180 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 SEMA3GQ9NS98 782 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ARMCX1Q9P291 453 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 CES1P1Q9UKY3 287 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 KNTC1P50748 2209 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 SCN3AQ9NY46 2000 aa13.49□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 CEP250Q9BV73 2442 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 A0A1W2PRB8 838 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PMS2P1A4D2B8 440 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 CCT8L1PA6NM43 557 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 DNAJB6O75190 326 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 SLC35E2P0CK97 266 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 TNNI3P19429 210 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 GALNSP34059 522 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 STAT5AP42229 794 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PLIN5Q00G26 463 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 FOLH1Q04609 750 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 RCAN2Q14206 197 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ERV3-1Q14264 604 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 MLC1Q15049 377 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 NSDHLQ15738 373 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 UGT8Q16880 541 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 COQ5Q5HYK3 327 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 MARCH9Q86YJ5 346 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 DTWD1Q8N5C7 304 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 TRIML2Q8N7C3 387 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 OR2Y1Q8NGV0 311 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 OR5P2Q8WZ92 322 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 DGAT2Q96PD7 388 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 CRB3Q9BUF7 120 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ACTL8Q9H568 366 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 SLC22A11Q9NSA0 550 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 GID8Q9NWU2 228 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 BTNL2Q9UIR0 455 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 C3orf18Q9UK00 162 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 KLK13Q9UKR3 277 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PTPRBP23467 1997 aa13.48□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 LOC100653049A0A140TA62 436 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 IDSB3KWA1 339 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ATP5HO75947 161 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 KRT34O76011 436 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ANP32DO95626 131 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 NPPAP01160 153 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 IFNA16P05015 189 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 LAMP1P11279 417 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 COX4I1P13073 169 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 CPMP14384 443 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 PTPN4P29074 926 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 GPC1P35052 558 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 DLSTP36957 453 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 DNASE1L3Q13609 305 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 SSPNQ14714 243 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 TBC1D25Q3MII6 688 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 BHLHB9Q6PI77 547 aa13.47□□□□□ -0.25
TSTA3-205ENST00000527006 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms