RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF639Q9UID6 485 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 A8MXE2 369 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CLGNO14967 610 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 EMC8O43402 210 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 OR1F1O43749 312 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 OR2J2O76002 312 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FESP07332 822 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MGAT1P26572 445 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SLC1A2P43004 574 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEA5P43359 124 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM198Q66K66 360 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FAR2Q96K12 515 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MS4A8Q9BY19 250 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 DERL2Q9GZP9 239 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FRG2CA6NGY1 282 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CGAP01215 116 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 APRTP07741 180 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35E2P0CK97 266 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 GRIA1P42261 906 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PTH2RP49190 550 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FNTAP49354 379 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 GFRA1P56159 465 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 BTG2P78543 158 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 NAE1Q13564 534 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 Q5PR19 223 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM139Q8IV31 216 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 NAT14Q8WUY8 206 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 BOD1Q96IK1 185 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MYO1DO94832 1006 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SRD5A2P31213 254 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CD79BP40259 229 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V0D1P61421 351 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PLIN5Q00G26 463 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TNFRSF17Q02223 184 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 KIF5AQ12840 1032 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CUL3Q13618 768 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CEBPEQ15744 281 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35A4Q96G79 324 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf159Q96HA4 380 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CTAGE9A4FU28 777 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 AIFM1O95831 613 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF708P17019 499 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SLC37A1P57057 533 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 RCAN2Q14206 197 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MORF4L2Q15014 288 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB134Q4QY38 66 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 XKR6Q5GH73 641 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.05□□□□□ -1.28
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