RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1B0GTI1 187 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 DUXAA6NLW8 204 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 KLRF2D3W0D1 207 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TPST2O60704 377 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PMPCBO75439 489 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CNTN5O94779 1100 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TIAF1O95411 115 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TSPAN12O95859 305 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 APOC1P02654 83 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OCM2P0CE71 109 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GIMD1P0DJR0 217 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ITGAMP11215 1152 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 UGT1A4P22310 534 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PSMB4P28070 264 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SSTR1P30872 391 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CASP14P31944 242 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 UGT1A3P35503 534 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 UGT1A5P35504 534 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MAGEA3P43357 314 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RBBP4Q09028 425 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TRIP10Q15642 601 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CHI3L2Q15782 390 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RPE65Q16518 533 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ACKR1Q16570 336 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 IMPG1Q17R60 797 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GTDC1Q4AE62 458 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PDIK1LQ8N165 341 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SYT14Q8NB59 555 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ACBD4Q8NC06 268 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OR4A16Q8NH70 328 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 KCNJ9Q92806 393 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 LENG9Q96B70 501 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PHF21AQ96BD5 680 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 REPS1Q96D71 796 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MUS81Q96NY9 551 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OR5B2Q96R09 309 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TSC22D3Q99576 134 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 HDAC8Q9BY41 377 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 EQTNQ9NQ60 294 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 JKAMPQ9P055 326 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 KLQ9UEF7 1012 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RNF114Q9Y508 228 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.86□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF521Q96K83 1311 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM129A0AVI4 362 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MTMR11A4FU01 709 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM238C9JI98 176 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CCSO14618 274 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RAB29O14966 203 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GSTT2P0CG29 244 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GSTT2BP0CG30 244 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms