RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493441.5

SMYD3-217, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene SMYD3, Length 823 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-217ENST00000493441 SPHARQ15513 63 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 GPAT3Q53EU6 434 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 CTR9Q6PD62 1173 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 PHYHIPQ92561 330 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TXNDC15Q96J42 360 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 LRR1Q96L50 414 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 S1PR3Q99500 378 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 PANK3Q9H999 370 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 NSG2Q9Y328 171 aa6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TJP1Q07157 1748 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 A0A0G2JNG1 304 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RNF222A6NCQ9 220 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TULP2O00295 520 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 MT-ND1P03886 318 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 GP9P14770 177 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ALDH4A1P30038 563 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 PPP2R1AP30153 589 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 AXLP30530 894 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TRIM23P36406 574 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RGS4P49798 205 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 CNTN2Q02246 1040 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 SP3Q02447 781 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 PLD1Q13393 1074 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 FOXE3Q13461 319 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 MTX1Q13505 466 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 KIR2DS5Q14953 304 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RDM1Q8NG50 284 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 LPAR1Q92633 364 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 P3H4Q92791 437 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM45BQ96B21 275 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 MARK4Q96L34 752 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 BDH2Q9BUT1 245 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 GON7Q9BXV9 100 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RNF121Q9H920 327 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 LTBP1Q14766 1721 aa6.7□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 SERINC4A6NH21 518 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 K7ESM1 405 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 EXTL3O43909 919 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ECE2O60344 883 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 WDR1O75083 606 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 UFL1O94874 794 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TFAP2AP05549 437 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 MYOD1P15172 320 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ENTPD1P49961 510 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 THOP1P52888 689 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TAF10Q12962 218 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 NME3Q13232 169 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TATDN3Q17R31 274 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 TRNP1Q6NT89 227 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-217ENST00000493441 ARL14Q8N4G2 192 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms