RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486268.5

ERGIC3-215, Transcript of ERGIC and golgi 3, human

TSL 2

Gene ERGIC3, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERGIC3-215	ENST00000486268	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	IL21R	Q9HBE5	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF639	Q9UID6	485 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268		A0A1W2PR48	441 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268		H0YGG7	62 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	PPM1D	O15297	605 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	DPM1	O60762	260 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	PRKD3	O94806	890 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	RASAL1	O95294	804 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	AIFM1	O95831	613 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	NTRK1	P04629	796 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	NR2F6	P10588	404 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CERS1	P27544	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	MPI	P34949	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SOAT1	P35610	550 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CRAT	P43155	626 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	MAGEA2	P43356	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	PRIM2	P49643	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	BTN3A2	P78410	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	TNFRSF17	Q02223	184 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	FOLH1	Q04609	750 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SHB	Q15464	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	C10orf111	Q8N326	155 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	FBXO30	Q8TB52	745 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	BBS4	Q96RK4	519 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRIM4	Q9C037	500 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268		A0A0G2JN53	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	BLACE	A4D250	179 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	C4orf51	C9J302	202 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SUV39H1	O43463	412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	GDF9	O60383	454 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLITRK5	O94991	958 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	IFI6	P09912	130 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ARAF	P10398	606 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CDH3	P22223	829 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SOX11	P35716	441 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	GPR3	P46089	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	LSS	P48449	732 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	DSTN	P60981	165 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	RAB8A	P61006	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SCARB2	Q14108	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SPIDR	Q14159	915 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	HLA-B	Q31612	363 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	MMP21	Q8N119	569 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	AMER3	Q8N944	861 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ERGIC3-215	ENST00000486268	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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