RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485274.1

GPATCH2-204, Transcript of G-patch domain containing 2, human

TSL 3

Gene GPATCH2, Length 343 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH2-204	ENST00000485274	FAM107A	O95990	144 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PAEP	P09466	180 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	UCHL3	P15374	230 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	FER	P16591	822 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	GAP43	P17677	238 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PSMB4	P28070	264 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	FNTA	P49354	379 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CACNG1	Q06432	222 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	TEAD2	Q15562	447 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	LRR1	Q96L50	414 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PSMB7	Q99436	277 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	LITAF	Q99732	161 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	SLC30A4	O14863	429 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	FLRT2	O43155	660 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	SLC7A4	O43246	635 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	SELENOF	O60613	162 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	KRT14	P02533	472 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	RAF1	P04049	648 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	HMBS	P08397	361 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	MUT	P22033	750 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	RPA1	P27694	616 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	EPS15	P42566	896 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	GIT2	Q14161	759 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	EXT1	Q16394	746 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	RBBP7	Q16576	425 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	UBE2S	Q16763	222 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274		Q6ZTC4	211 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	P3H4	Q92791	437 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	RIT1	Q92963	219 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	PGM2	Q96G03	612 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	NDN	Q99608	321 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPATCH2-204	ENST00000485274	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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