RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482232.1

GTF2I-208, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-208ENST00000482232 CHD9Q3L8U1 2897 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PGRMC2O15173 223 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SEC22BO75396 215 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 OLFM2O95897 454 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 GSRP00390 522 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 IGHEP01854 428 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SOX3P41225 446 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 OR3A2P47893 321 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 NT5C2P49902 561 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SLC12A3P55017 1021 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TMEM50BP56557 158 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 RPS8P62241 208 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 DLK1P80370 383 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 MZT1Q08AG7 82 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TRIM29Q14134 588 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 VGLL4Q14135 290 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SHHQ15465 462 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TMEM270Q6UE05 265 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 FRRS1Q6ZNA5 592 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ERO1BQ86YB8 467 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 LYG1Q8N1E2 194 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 NUP37Q8NFH4 326 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 OMA1Q96E52 524 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 LRRC61Q9BV99 259 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ACTL8Q9H568 366 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SYCE3A1L190 88 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 CCL24O00175 119 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 IDH3BO43837 385 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 UFL1O94874 794 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 GUCA1CO95843 209 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SHC1P29353 583 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 NME5P56597 212 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 IRX4P78413 519 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 NPRL3Q12980 569 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PPIL2Q13356 520 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 CDH18Q13634 790 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TAZQ16635 292 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 GALNT17Q6IS24 598 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 EXT2Q93063 718 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 C1orf21Q9H246 121 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 NDE1Q9NXR1 346 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 FETUBQ9UGM5 382 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 CDH7Q9ULB5 785 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 WIPI2Q9Y4P8 454 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 A0A0G2JMZ2 1700 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SMIM30A4D0T7 59 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 CCDC188H7C350 402 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TXNL1O43396 289 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 RTN2O75298 545 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 RPS6KA5O75582 802 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 REC8O95072 547 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 FAM58BPP0C7Q3 252 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 KCNJ1P48048 391 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 STX1BP61266 288 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ARF5P84085 180 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ENPP2Q13822 863 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PTGISQ16647 500 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 Q8NBF4 154 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms