RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469793.1

RAD18-208, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RAD18, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD18-208	ENST00000469793	GPR75	O95800	540 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	MAOA	P21397	527 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	OTX2	P32243	289 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	DIO3	P55073	304 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	GNGT1	P63211	74 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	FOLH1	Q04609	750 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PDE7A	Q13946	482 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	SERTAD2	Q14140	314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PTGR1	Q14914	329 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	NSDHL	Q15738	373 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	MMP21	Q8N119	569 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	EBF4	Q9BQW3	602 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	AIG1	Q9NVV5	245 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CDC14C	A4D256	554 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	GLOD5	A6NK44	160 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PGRMC2	O15173	223 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	NKX2-8	O15522	239 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	LDB3	O75112	727 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	FURIN	P09958	794 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	G6PD	P11413	515 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	COX6A1	P12074	109 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PIK3R1	P27986	724 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ITPKB	P27987	946 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	HPCAL1	P37235	193 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	C2orf80	Q0P641	193 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	STX4	Q12846	297 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	TERF2	Q15554	542 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	GSTA3	Q16772	222 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CPZ	Q66K79	652 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	UCN3	Q969E3	161 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793		A0A0G2JND7	137 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	IDO1	P14902	403 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	STT3A	P46977	705 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CLDN8	P56748	225 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PLIN5	Q00G26	463 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PCOLCE	Q15113	449 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CEBPE	Q15744	281 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF681	Q96N22	645 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RAD18-208	ENST00000469793	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		13.48	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms