RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-204ENST00000466539 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.86□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.86□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.86□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.86□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.86□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SEC16AO15027 2179 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ALG1L2C9J202 215 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CLGNO14967 610 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 NRP2O60462 931 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CDC14BO60729 498 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TBX19O60806 448 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 DIAPH2O60879 1101 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SCN2BO60939 215 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TMEM127O75204 238 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CCNDBP1O95273 360 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 VIPP01282 170 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 LINC00032P0C843 101 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SPTBP11277 2137 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CDH1P12830 882 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 OSMP13725 252 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CTSEP14091 401 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 IDO1P14902 403 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 EZRP15311 586 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 UGT2B7P16662 529 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 LBPP18428 481 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CXCR2P25025 360 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PTPN6P29350 595 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 IL12AP29459 219 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 KIR2DL3P43628 341 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CCR8P51685 355 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 DIO3P55073 304 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 NCALDP61601 193 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 HHEXQ03014 270 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TCF15Q12870 199 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 IFT88Q13099 833 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 KLF10Q13118 480 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 C1orf61Q13536 156 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PDE7AQ13946 482 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SQLEQ14534 574 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 RBBP7Q16576 425 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 MUM1Q2TAK8 710 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 HLA-BQ31612 363 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 XKR6Q5GH73 641 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 MANEAQ5SRI9 462 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 MED27Q6P2C8 311 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SPESP1Q6UW49 350 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TMPRSS11BQ86T26 416 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 C17orf64Q86WR6 236 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 METTL4Q8N3J2 472 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 DPP10Q8N608 796 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 OR6C4Q8NGE1 309 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 NT5CQ8TCD5 201 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 AGR3Q8TD06 166 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 LCN9Q8WX39 176 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 UBE2E3Q969T4 207 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TESCQ96BS2 214 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CXorf40BQ96DE9 158 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ERP27Q96DN0 273 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TEX37Q96LM6 180 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CD180Q99467 661 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ABCG4Q9H172 646 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 XKR8Q9H6D3 395 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 C1orf109Q9NX04 203 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CIDEBQ9UHD4 219 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 MOSPD1Q9UJG1 213 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 BTRCQ9Y297 605 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms