RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 APIPQ96GX9 242 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS50Q96JG6 964 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FRG2BQ96QU4 278 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC77Q9BR77 488 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MECRQ9BV79 373 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLMPQ9H6B4 373 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PPT2Q9UMR5 302 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5H15A6NDH6 313 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 GABRR3A8MPY1 467 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 LCE2BO14633 110 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH16O75309 829 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA7AO75326 666 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 AIFM1O95831 613 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ALPPP05187 535 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TAC1P20366 129 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB1P30740 379 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDH3A1P30838 453 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TDGF1P3P51864 188 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 RAP1GDS1P52306 607 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SKP1P63208 163 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 HMGCS1Q01581 520 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 FOLH1Q04609 750 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT88Q13099 833 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 NR6A1Q15406 480 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MEP1AQ16819 746 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 BRICD5Q6PL45 260 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCKQ8N0W5 287 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MREGQ8N565 214 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ZIM3Q96PE6 472 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF382Q96SR6 550 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINI1Q99574 410 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ACPTQ9BZG2 426 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL1Q9NR64 748 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP10Q9P2G4 905 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 HEY2Q9UBP5 337 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PLLPQ9Y342 182 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNA1DQ01668 2161 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A088AWK7 358 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SERTM1A2A2V5 107 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 DYTNA2CJ06 578 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PINLYPA6NC86 204 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf105B2RV13 164 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 WWP2O00308 870 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN4O14493 209 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 COPEO14579 308 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TYROBPO43914 113 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL41O60662 606 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF2O60811 474 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA3DO95025 777 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR75O95800 540 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 OTCP00480 354 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV3-11P04433 115 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNA16P05015 189 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNGP07510 517 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MYL2P10916 166 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CPA3P15088 417 aa6.51□□□□□ -1.37
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