RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 G2E3Q7L622 706 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PTF1AQ7RTS3 328 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM228AQ86W67 206 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM219Q86XT9 240 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PGBD5Q8N414 524 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL14Q8N4G2 192 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NECAB1Q8N987 351 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CNBD1Q8NA66 436 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM184AQ8NB25 1140 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MIPOL1Q8TD10 442 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 HSD17B8Q92506 261 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SUSD6Q92537 303 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 IGSF21Q96ID5 467 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 HPDLQ96IR7 371 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 VSTM2LQ96N03 204 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CASD1Q96PB1 797 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GSDMAQ96QA5 445 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 USP28Q96RU2 1077 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SEMA4CQ9C0C4 833 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM192AQ9GZU8 254 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 FANCEQ9HB96 536 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 INSL6Q9Y581 213 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 R4GN57 208 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 STRCP1A6NGW2 1772 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PARD3Q8TEW0 1356 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP10BO94823 1461 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPRUQ92729 1446 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CPS1P31327 1500 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A075B6Q4 140 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GVT2 93 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SERINC4A6NH21 518 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 OR52A4PA6NMU1 304 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 WASH3PC4AMC7 463 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TM7SF2O76062 418 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EML2O95834 649 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 AGTP01019 485 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV2-14P01704 120 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHEP01854 428 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRNA1P02708 482 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MT-ND2P03891 347 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPN1P07384 714 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00271P0C7V0 271 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGA2P17301 1181 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ACKR3P25106 362 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIA1P42261 906 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NPY2RP49146 381 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LIMK2P53671 638 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZXDAP98168 799 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 OR1C1Q15619 314 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SSX2Q16385 188 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM171BQ6P995 826 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 WASH2PQ6VEQ5 465 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SYT10Q6XYQ8 523 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6ZPA2 131 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 KMT5CQ86Y97 462 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PHC2Q8IXK0 858 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2J2Q8N2K1 259 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKFN1Q8N957 763 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC197Q8NCU1 140 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RAET1EQ8TD07 263 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TESK2Q96S53 571 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT12Q99456 494 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LAT2Q9GZY6 243 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EBF3Q9H4W6 596 aa4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms